A Naruto az ifjú ninják történetét meséli el, többek között Narutoét, és csapattársaiét Sasukeét és Sakuráét. Végigkísérhetjük, hogy hogyan oktatja harcra és csapatmunkára őket a tanáruk Kakashi és hogy hogyan igyekeznek, feltornázni magukat a ranglétrán. A történet közben persze megismerhetünk rengeteg új szereplőt, ellenséget, riválist és barátot. Aki szereti az akciót és a humort az ne hagyja ki.